Registro:
Título en inglés:
Long noncoding RNA - mediated epigenetic regulation of auxin - related genes controls shade avoidance syndrome in Arabidopsis
Autor/es:
Mammarella, María Florencia; Lucero, Leandro; Hussain, Nosheen; Muñoz López, Aitor; Huang, Ying; Ferrero, Lucía; Fernández Milmanda, Guadalupe L.; Manavella, Pablo; Benhamed, Moussa; Crespi, Martín; Ballaré, Carlos Luis; Gutiérrez Marcos, José; Cubas, Pilar; Ariel, Federico
Filiación:
Mammarella, María Florencia. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Mammarella, María Florencia. CONICET - Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Lucero, Leandro. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Lucero, Leandro. CONICET - Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Hussain, Nosheen University of Warwick. School of Life Sciences. Coventry, Reino Unido.
Muñoz López, Aitor. Universidad Autónoma de Madrid. Departamento de Genética Molecular de Plantas. Centro Nacional de Biotecnología. Madrid, España.
Muñoz López, Aitor. Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Universidad Autónoma de Madrid. Plant Molecular Genetics Department. Centro Nacional de Biotecnología. Madrid, España.
Huang, Ying. Universite Evry - Universite Paris-Saclay. Institute of Plant Sciences Paris Saclay (IPS2). Orsay, Francia.
Huang, Ying. Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Orsay, France.
Huang, Ying. Universite de Paris. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2). Orsay, Francia.
Ferrero, Lucía. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Ferrero, Lucía. CONICET - Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Fernández Milmanda, Guadalupe L. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura (IFEVA). Buenos Aires, Argentina.
Fernández Milmanda, Guadalupe L. CONICET - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura (IFEVA). Buenos Aires, Argentina.
Manavella, Pablo. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Manavella, Pablo. CONICET - Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Benhamed, Moussa. Universite Evry - Universite Paris-Saclay. Institute of Plant Sciences Paris Saclay (IPS2). Orsay, Francia.
Benhamed, Moussa. Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Orsay, Francia.
Benhamed, Moussa. Universite de Paris. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2). Orsay, Francia.
Crespi, Martín. Universite Evry - Universite Paris-Saclay. Institute of Plant Sciences Paris Saclay (IPS2). Orsay, Francia.
Crespi, Martín. Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Orsay, Francia.
Crespi, Martín. Universite de Paris. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2). Orsay, Francia.
Ballaré, Carlos Luis. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura (IFEVA). Buenos Aires, Argentina.
Ballaré, Carlos Luis. CONICET - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura (IFEVA). Buenos Aires, Argentina.
Ballaré, Carlos Luis. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIBIO). Buenos Aires, Argentina.
Ballaré, Carlos Luis. CONICET - Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIBIO). Buenos Aires, Argentina.
Gutiérrez Marcos, José. University of Warwick. School of Life Sciences. Coventry, Reino Unido.
Cubas, Pilar. Universidad Autónoma de Madrid. Departamento de Genética Molecular de Plantas. Centro Nacional de Biotecnología. Madrid, España.
Cubas, Pilar. Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Universidad Autónoma de Madrid. Departamento de Genética Molecular de Plantas. Centro Nacional de Biotecnología. Madrid, España.
Ariel, Federico. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Ariel, Federico. CONICET - Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Agrobiotecnología del Litoral. Santa Fe, Argentina.
Título revista:
The EMBO Journal
ISSN:
1460-2075 (en línea)
Temas:
APOLO LONG NONCODING RNA; CHROMATIN CONFORMATION; HYPONASTY; SHADE-AVOIDANCE SYNDROME; SHOOT BRANCHING
Resumen:
The long noncoding RNA (lncRNA) AUXIN-REGULATED PROMOTER LOOP (APOLO) recognizes a subset of target loci across the Arabidopsis thaliana genome by forming RNA–DNA hybrids (R-loops) and modulating local three-dimensional chromatin conformation. Here, we show that APOLO regulates shade avoidance syndrome by dynamically modulating expression of key factors. In response to far-red (FR) light, expression of APOLO anti-correlates with that of its target BRANCHED1 (BRC1), a master regulator of shoot branching in Arabidopsis thaliana. APOLO deregulation results in BRC1 transcriptional repression and an increase in the number of branches. Accumulation of APOLO transcription fine-tunes the formation of a repressive chromatin loop encompassing the BRC1 promoter, which normally occurs only in leaves and in a late response to far-red light treatment in axillary buds. In addition, our data reveal that APOLO participates in leaf hyponasty, in agreement with its previously reported role in the control of auxin homeostasis through direct modulation of auxin synthesis gene YUCCA2, and auxin efflux genes PID and WAG2. We show that direct application of APOLO RNA to leaves results in a rapid increase in auxin signaling that is associated with changes in the plant response to far-red light. Collectively, our data support the view that lncRNAs coordinate shade avoidance syndrome in A. thaliana, and reveal their potential as exogenous bioactive molecules. Deploying exogenous RNAs that modulate plant–environment interactions may therefore become a new tool for sustainable agriculture.
Citación:
---------- APA ----------
Mammarella, M. F.; Lucero, L.; Hussain, N.; Muñoz López, A.; Huang, Y.; Ferrero, L.; Fernández Milmanda, G. L.; Manavella, P.; Benhamed, M.; Crespi, M.; Ballaré, C. L.; Gutiérrez Marcos, J.; Cubas, P. & Ariel, F. (2023). Long noncoding RNA - mediated epigenetic regulation of auxin - related genes controls shade avoidance syndrome in Arabidopsis. The EMBO Journal,42, (24),e113941
10.15252/embj.2023113941
---------- CHICAGO ----------
Mammarella, María Florencia,Lucero, Leandro,Hussain, Nosheen,Muñoz López, Aitor,Huang, Ying,Ferrero, Lucía, et al.. 2023. "Long noncoding RNA - mediated epigenetic regulation of auxin - related genes controls shade avoidance syndrome in Arabidopsis". The EMBO Journal 42, no.24:e113941.
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