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Alvarez Cecco, P.; Rogberg Muñoz, A.; Balbi, M.; Bonamy, M.; Munilla Leguizamón, S.; Forneris, N. S.; Peral García, P.; Cantet, R. J. C.; Giovambattista, G. & Fernández Long, M. E. (2022)"Genome - wide scan for signatures of selection in the brangus cattle genome".Journal of Animal Breeding and Genetics,139, (6),p.679-694

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FAUBA

Registro:

Documento:
Artículo
Título en inglés:
Genome - wide scan for signatures of selection in the brangus cattle genome
Autor/es:
Alvarez Cecco, Paulo; Rogberg Muñoz, Andrés; Balbi, Marianela; Bonamy, Martin; Munilla Leguizamón, Sebastián; Forneris, Natalia Soledad; Peral García, Pilar; Cantet, Rodolfo Juan Carlos; Giovambattista, Guillermo; Fernández Long, María Elena
Filiación:
Alvarez Cecco, Paulo. Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Alvarez Cecco, Paulo. CONICET - Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Rogberg Muñoz, Andrés. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Buenos Aires, Argentina.
Rogberg Muñoz, Andrés. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA). Buenos Aires, Argentina.
Rogberg Muñoz, Andrés. CONICET - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA). Buenos Aires, Argentina.
Balbi, Marianela. Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Balbi, Marianela. CONICET - Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Bonamy, Martin. Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Bonamy, Martin. CONICET - Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Munilla Leguizamón, Sebastián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Buenos Aires, Argentina.
Munilla Leguizamón, Sebastián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA). Buenos Aires, Argentina.
Munilla Leguizamón, Sebastián. CONICET - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA). Buenos Aires, Argentina.
Forneris, Natalia Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Buenos Aires, Argentina.
Forneris, Natalia Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA). Buenos Aires, Argentina.
Forneris, Natalia Soledad. CONICET - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA). Buenos Aires, Argentina.
Peral García, Pilar. Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Peral García, Pilar. CONICET - Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Cantet, Rodolfo Juan Carlos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Buenos Aires, Argentina.
Cantet, Rodolfo Juan Carlos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA). Buenos Aires, Argentina.
Cantet, Rodolfo Juan Carlos. CONICET - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA). Buenos Aires, Argentina.
Giovambattista, Guillermo. Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Giovambattista, Guillermo. CONICET - Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Fernández Long, María Elena. Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Fernández Long, María Elena. CONICET - Universidad Nacional de La Plata (UNLP). Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET). La Plata, Buenos Aires, Argentina.
Año:
2022
Título revista:
Journal of Animal Breeding and Genetics
ISSN:
0931-2668 (impreso); 1439-0388 (en línea)
Volumen:
139
Número:
6
Páginas:
679-694
DOI:
10.1111/jbg.12733
Temas:
ADAPTATION; CATTLE; CROSSBREED
Idioma:
Inglés
Material asociado:
Material Complementario 1:http://ri.agro.uba.ar/files/intranet/articulo/2022alvarezcecco-c1.xlsx
Material Complementario 2:http://ri.agro.uba.ar/files/intranet/articulo/2022alvarezcecco-c2.xlsx
URL al Editor:
https://www.wiley.com
URL al registro:
http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/arti/document/2022alvarezcecco
Url al documento en Intranet FAUBA:
http://ri.agro.uba.ar/files/intranet/articulo/2022alvarezcecco.pdf

Resumen:

Brangus is a composite cattle breed developed with the objective of combining the advantages of Angus and Zebuine breeds (Brahman, mainly) in tropical climates. The aim of this work was to estimate breed composition both genome-wide and locally, at the chromosome level, and to uncover genomic regions evidencing positive selection in the Argentinean Brangus population/nucleus. To do so, we analysed marker data from 478 animals, including Brangus, Angus and Brahman. Average breed composition was 35.0% ± 9.6% of Brahman, lower than expected according to the theoretical fractions deduced by the usual cross-breeding practice in this breed. Local ancestry analysis evidenced that breed composition varies between chromosomes, ranging from 19.6% for BTA26 to 56.1% for BTA5. Using approaches based on allelic frequencies and linkage disequilibrium, genomic regions with putative selection signatures were identified in several chromosomes (BTA1, BTA5, BTA6 and BTA14). These regions harbour genes involved in horn development, growth, lipid metabolism, reproduction and immune response. We argue that the overlapping of a chromosome segment originated in one of the parental breeds and over - represented in the sample with the location of a signature of selection constitutes evidence of a selection process that has occurred in the breed since its take off in the 1950s. In this regard, our results could contribute to the understanding of the genetic mechanisms involved in cross - bred cattle adaptation and productivity in tropical environments.

Citación:

---------- APA ----------

Alvarez Cecco, P.; Rogberg Muñoz, A.; Balbi, M.; Bonamy, M.; Munilla Leguizamón, S.; Forneris, N. S.; Peral García, P.; Cantet, R. J. C.; Giovambattista, G. & Fernández Long, M. E. (2022).Genome - wide scan for signatures of selection in the brangus cattle genome.Journal of Animal Breeding and Genetics,139, (6),p.679-694
10.1111/jbg.12733

---------- CHICAGO ----------

Alvarez Cecco, Paulo,Rogberg Muñoz, Andrés,Balbi, Marianela,Bonamy, Martin,Munilla Leguizamón, Sebastián,Forneris, Natalia Soledad, et al..2022. "Genome - wide scan for signatures of selection in the brangus cattle genome".Journal of Animal Breeding and Genetics 139, no.6:679-694.
Recuperado de  http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/arti/document/2022alvarezcecco