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Ortiz Rocca, L. M. (2025). Diversidad de la comunidad microbiana del suelo bajo diferentes manejos en la implantación y cosecha de caña de azúcar. Tesis para obtener el grado de Magister de la Universidad de Buenos Aires área Producción Vegetal otorgado por la Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Escuela para Graduados. Fauba Digital http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/tesis/document/2025ortizroccaluciamartina
Los microorganismos del suelo cumplen funciones esenciales en el sostenimiento de los agroecosistemas, ya que regulan procesos como el ciclado de nutrientes, la emisión de gases de efecto invernadero y la estructuración del suelo. Este trabajo estudia la diversidad microbiana en suelos cultivados con caña de azúcar bajo distintas prácticas de manejo, evaluando tanto su estructura taxonómica como su potencial funcional. El objetivo principal es caracterizar los cambios en la comunidad microbiana del suelo y en genes funcionales clave (nirK, nirS, nosZ, amoA, mcrA, pmoA), asociados al ciclo del nitrógeno y del metano, en respuesta a tratamientos combinados de tipo de labranza (convencional o en franjas) y tipo de cosecha (liviana o convencional). Las hipótesis plantean que el manejo conservacionista promueve una mayor diversidad microbiana y contribuye a mitigar las emisiones de gases de efecto invernadero. La estrategia metodológica combina enfoques multi-ómicos: cuantificación de genes por qPCR, análisis de diversidad mediante secuenciación del gen 16S rRNA, ensamblado metagenómico y generación de genomas ensamblados a partir de metagenomas (MAGs). También se aplica inferencia funcional con PICRUSt2 y anotación de proteínas a partir de marcos de lectura abiertos (ORFs). Los resultados muestran que el tipo de labranza tiene un efecto más marcado que el tipo de manejo sobre la estructura de la comunidad bacteriana, con mayor riqueza observada en sistemas de labranza en franjas. En cuanto a los genes funcionales, se registra una disminución de mcrA y un aumento de nirK en otoño, lo que indicaría un posible cambio en las rutas de metanogénesis y desnitrificación. La secuenciación de amplicones permite una detección robusta de la diversidad microbiana, mientras que la metagenómica ensamblada aporta información funcional complementaria, aunque con una recuperación limitada de MAGs de alta calidad. Este trabajo evidencia el impacto diferencial de las prácticas agrícolas sobre la microbiota del suelo y destaca la utilidad de los enfoques multi-ómicos para comprender su funcionalidad ecológica en sistemas productivos complejos.
Ortiz Rocca, L. M. (2025). Diversidad de la comunidad microbiana del suelo bajo diferentes manejos en la implantación y cosecha de caña de azúcar. [Tesis de Maestría, Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Escuela para Graduados]. Fauba Digital http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/tesis/document/2025ortizroccaluciamartina
Ortiz Rocca, Lucía Martina. "Diversidad de la comunidad microbiana del suelo bajo diferentes manejos en la implantación y cosecha de caña de azúcar". (Tesis de Maestría, Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Escuela para Graduados, 2025), http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/tesis/document/2025ortizroccaluciamartina