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Alvarez, F.; Simonetti, E.; Draghi, W. O.; Vinacour, M.; Palumbo, M. C.; Fernández Do Porto, D. A.; Montecchia, M. S.; Roberts, I. N. & Ruiz, J. A. (2022)"Genome mining of Burkholderia ambifaria strain T16, a rhizobacterium able to produce antimicrobial compounds and degrade the mycotoxin fusaric acid". World Journal of Microbiology and Biotechnology,38, (7),art.114

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Registro:

Documento:
Artículo
Título en inglés:
Genome mining of Burkholderia ambifaria strain T16, a rhizobacterium able to produce antimicrobial compounds and degrade the mycotoxin fusaric acid
Autor/es:
Alvarez, Florencia; Simonetti, Ester; Draghi, Walter Omar; Vinacour, Matías; Palumbo, Miranda C.; Fernández Do Porto, Darío Augusto; Montecchia, Marcela Susana; Roberts, Irma N.; Ruíz, Jimena Alicia
Filiación:
Alvarez, Florencia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Alvarez, Florencia. CONICET – Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Simonetti, Ester. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Simonetti, Ester. CONICET – Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Draghi, Walter Omar. Universidad de La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular (IBBM). La Plata, Argentina.
Draghi, Walter Omar. CONICET - Universidad de La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular (IBBM). La Plata, Argentina.
Vinacour, Matías. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Vinacour, Matías. CONICET – Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Palumbo, Miranda C. Universidad de Buenos Aires, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo (IC). Buenos Aires, Argentina.
Palumbo, Miranda C. CONICET - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo (IC). Buenos Aires, Argentina.
Fernández Do Porto, Darío Augusto. Universidad de Buenos Aires, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo (IC). Buenos Aires, Argentina.
Fernández Do Porto, Darío Augusto. CONICET - Universidad de Buenos Aires, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo (IC). Buenos Aires, Argentina.
Fernández Do Porto, Darío Augusto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (IQUIBICEN). Buenos Aires, Argentina.
Fernández Do Porto, Darío Augusto. CONICET - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (IQUIBICEN). Buenos Aires, Argentina.
Montecchia, Marcela Susana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía.Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Montecchia, Marcela Susana. CONICET – Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Roberts, Irma N. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Roberts, Irma N. CONICET – Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Ruíz, Jimena Alicia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Ruíz, Jimena Alicia. CONICET – Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales (INBA). Buenos Aires, Argentina.
Año:
2022
Título revista:
World Journal of Microbiology and Biotechnology
ISSN:
1573-0972
Volumen:
38
Número:
7
Páginas:
art.114.
DOI:
10.1007/s11274-022-03299-0
Temas:
ANTIMICROBIAL COMPOUNDS; FLAVIN - DEPENDENT MONOOXYGENASES; GENOME - BASED ANALYSIS; MYCOTOXIN; SECONDARY METABOLITES
Idioma:
Inglés
Material asociado:
Material Complementario:http://ri.agro.uba.ar/files/intranet/articulo/2022alvarez1-c1.xlsx
URL al Editor:
https://www.springer.com
URL al registro:
http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/arti/document/2022alvarez1
Url al documento en Intranet FAUBA:
http://ri.agro.uba.ar/files/intranet/articulo/2022alvarez1.pdf

Resumen:

Burkholderia ambifaria T16 is a bacterium isolated from the rhizosphere of barley plants that showed a remarkable antifungal activity. This strain was also able to degrade fusaric acid [5-Butylpyridine - 2 - carboxylic acid] and detoxify this mycotoxin in inoculated barley seedlings. Genes and enzymes responsible for fusaric acid degradation have an important biotechnological potential in the control of fungal diseases caused by fusaric acid producers, or in the biodegradation/bio catalysis processes of pyridine derivatives. In this study, the complete genome of B. ambifaria T16 was sequenced and analyzed to identify genes involved in survival and competition in the rhizosphere, plant growth promotion, fungal growth inhibition, and degradation of aromatic compounds. The genomic analysis revealed the presence of several operons for the biosynthesis of antimicrobial compounds, such as pyrrolnitrin, ornibactin, occidiofungin and the membrane-associated AFC - BC11. These compounds were also detected in bacterial culture supernatants by mass spectrometry analysis. In addition, this strain has multiple genes contributing to its plant growth-promoting profile, including those for acetoin, 2,3 - butanediol and indole - 3 - acetic acid production, siderophores biosynthesis, and solubilisation of organic and inorganic phosphate. A pan - genomic analysis demonstrated that the genome of strain T16 possesses large gene clusters that are absent in the genomes of B. ambifaria reference strains. According to predictions, most of these clusters would be involved in aromatic compounds degradation. One genomic region, encoding flavin - dependent onooxygenases of unknown function, is proposed as a candidate responsible for fusaric acid degradation.

Citación:

---------- APA ----------

Alvarez, F.; Simonetti, E.; Draghi, W. O.; Vinacour, M.; Palumbo, M. C.; Fernández Do Porto, D. A.; Montecchia, M. S.; Roberts, I. N. & Ruiz, J. A. (2022). Genome mining of Burkholderia ambifaria strain T16, a rhizobacterium able to produce antimicrobial compounds and degrade the mycotoxin fusaric acid. World Journal of Microbiology and Biotechnology,38, (7),art.114
10.1007/s11274-022-03299-0

---------- CHICAGO ----------

Alvarez, Florencia,Simonetti, Ester,Draghi, Walter Omar,Vinacour, Matías,Palumbo, Miranda C.,Fernández Do Porto, Darío Augusto, et al.. 2022. "Genome mining of Burkholderia ambifaria strain T16, a rhizobacterium able to produce antimicrobial compounds and degrade the mycotoxin fusaric acid". World Journal of Microbiology and Biotechnology 38, no.7:art.114..
Recuperado de  http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/arti/document/2022alvarez1